La historia de Egipto comenzó hacia el milenio VI adC, cuando comenzaron a desarrollarse, en torno a pequeñas aldeas, actividades sedentarias de agricultura y ganadería, dando inicio al Neolítico en Egipto.
Egipto: 5500-4000 adC
Entre los años 5500 y 4000 adC se desarrollo en Egipto, la cultura baradiense en los alrededores del yacimiento de el-Badari (Egipto Medio y el Alto Egipto), y posteriormente, se desarrolló en el Bajo Egipto otra cultura mucho menos avanzada situada en Merimdé (rivera occidental del delta del Nilo).
Egipto: 4000-3500 adC
Hacia el 4000 adC el foco de la cultura egipcia se desplazo hacia al-Amrah. Durante este periodo se produjo una gran difusión de la cerámica y se comenzó a usar el cobre (periodo calcolítico).
Egipto: 3500-3200 adC
Entre los años 3500 y 3200 adC se desarrollaron dos culturas en Egipto: la gerzeense (Alto y Medio Egipto) y la cultura Maadi (Bajo Egipto).
Durante esta época se realizaron las primeras obras de regadío y canalización del río Nilo en Egipto, lo que hizo que la población aumentara de manera considerable.
Egipto: 3200-3050 adC
Ya en el periodo Protodinástico (3200 – 3050 adC), las primeras comunidades se estructuraron en “nomos”. La cultura egipcia adopto una organización feudal y se llegaron a establecer dos reinos: el reino del Junco (su capital era Buto) y el Reino de la Abeja (su capital era Busilis). Ambos reinos estaban separados por el río Nilo. Con el tiempo, el Delta del Nilo se unifico, provocando que parte de los vencidos se desplazaran al Alto Egipto donde fundaron nuevas ciudades.
Finalmente, formaron un nuevo estado, y regresaron al Delta del Nilo o Bajo Egipto para conquistarlo. Menes, primer faraón de la historia de Egipto (3100 adC), fue el artífice de esta unificación del Alto y el bajo Egipto. La Prehistoria de Egipto llegaba a su fin, dando lugar a la civilización faraonica en Egipto